食物アレルギー。

食物アレルギーの原因は解明されていませんが、例えば、免疫機能が完成する３歳までに、清潔な環境においておくと、食べ物も異物として認識してしまうのではないか？という説もあります。

寄生虫説もありますし。

なかなか難しいところではあります。